Para incluir librerias sin tener que estar obligatoriamente donde se encuentra nuestra aplicación en PHP se recurre al archivo php.ini donde se hace un cambio en la linea donde se encuentra la variable include_path y se pone la ruta donde se encuentran las librerias, por ejemplo:
En Windows:
include_path = ".;c:\php\includes;c:\AppServ\php5\PEAR"
En UNIX:
include_path = ".:/php5/includes"
En Windows:
include_path = ".;c:\php\includes;c:\AppServ\php5\PEAR"
En UNIX:
include_path = ".:/php5/includes"